黑颈鹤I类MHC基因的克隆分离研究文献综述

 2022-08-03 16:10:26

鹤是对隶属鸟纲(Aves)、鹤形目(Gruiformes)、鹤科(Gmidae)动物的统称,其主要栖息于湖泊、浅滩、沼泽等湿地生境,属涉禽[1],[2]。世界上现存的鹤类共15种,其中有9种分布于中国,中国是世界上鹤类分布最多的国家,享有“鹤类乐园”的美誉。鹤是典型的单配制鸟类且寿命较长,作为忠贞、长寿、吉祥的符号,在中国及其他分布国的传统文化中占有重要地位。但由于农业和工业的发展,使得湿地生境不断减少和持续退化,鹤类动物野生种群数量正呈下降趋势[4],[5],[6]。在中国分布的鹤类动物中,蓑羽鹤(Anthropoides virgo)、黑颈鹤(Grus nigricollis)、白头鹤(Grus monacha)等被列为易危种,丹顶鹤(Grus japonensis)、赤颈鹤(Ardea antigone)等被IUCN列为濒危种。其中黑颈鹤同时也是《华盛顿公约》CITES 附录I物种,国家重点保护等级为一级,中国濒危动物红皮书等级为濒危。

黑颈鹤(Grus nigricollis),别称藏鹤、雁鹅、黑雁,是属于鹤科,鹤属的一种大型涉禽,体长110-120厘米,体重4-6千克。身体羽毛为灰白色,头部,前颈部羽毛和飞羽为黑色,尾羽为褐黑色。头部裸露部分为暗红色。黑颈鹤是唯一主要栖息在中国的鹤类,同时也是唯一一种一直栖息在高原的鹤类[15],[16]。黑颈鹤主要栖息于海拔2500-5000米的高原的沼泽地、湖泊及河滩地带。繁殖地主要在拉达克,中国西藏,青海等地,越冬地在印度东北部,中国西藏南部、贵州等地[15]

导致黑颈鹤成为濒危动物之一的原因有很多,例如栖息地的破坏和改变,人类捕杀,外来引入种群竞争、自身繁殖成活率低、国际性的环境污染等。但是其中最主要的原因是人类破坏环境和捕杀。随着种群数量的不断下降,黑颈鹤的种群越来越小,最终就会出现小种群问题,由于受到遗传漂变和近交作用的影响,黑颈鹤种群的遗传多样性会不断丧失,进而导致物种出现抗病力差,繁殖能力低,适应能力不强等问题[11]。所以,为了可以更好的保护这类极具价值的野生动物,我们需要对其的遗传情况进行了解并据此制定保护方案,这也是帮助黑颈鹤摆脱目前困境的重要方式。目前关于黑颈鹤的研究,主要集中在生境的选择,越冬习性,食物选择等宏观的方面[1],[2],[17],而微观方面的研究就相对较少,尤其是对种群遗传多样性的方面的数量那就更加的有限。

研究种群遗传多样性的方法多种多样,随着目前分子技术的发展,分子标记的技术在研究中起着越来越重要的作用。分子标记主要能分成两种,一种为中性的分子标记,一种是选择性的分子标记。中性的分子标记不受环境选择的影响所以参考的价值不是很大,而选择性的分子标记对环境较为敏感,容易受到环境选择的影响,所以使用选择性分子标记的研究较多,这类分子标记例如微卫星,线粒体,MHC等早已在此类研究中被广泛使用。其中,MHC能够很好的反映物种对目前环境的适应情况以及适应的进化过程,所以,利用MHC进行遗传多样性的研究相当之多。

主要组织相容性复合体(MHC)是一类在脊椎动物中广泛存在的紧密连锁的基因家族。它有着一系列多态性丰富的基因座位。它所编码的蛋白质可以识别并特异性结合抗原,然后呈递给相应的T细胞,引发之后的一系列免疫反应[9],[12]。所以MHC基因是脊椎动物免疫系统中的重要组成部分之一。由于MHC基因的多态性极为丰富,而且它的遗传变异的水平和动物抵御疾病的能力关系极为密切,所以利用MHC的变异水平来评估物种多样性情况无疑是十分有效的。同时,因为MHC是免疫系统的一部分,所以它同时还是评估生物个体和整个种群生存潜力的重要指标。

MHC基因家族由于结构和功能的不同,又可以再细分成三个亚族:经典Ⅰ类,非经典I类,经典II类,非经典II类和III类。其中,III类MHC基因编码的是一些补体成分,多态性较低,不参与抗原呈递过程,不和细胞膜结合[11],[12],[13]。所以,III类MHC基因在关于遗传多样性的研究中涉及的比较少。而I类和II类MHC基因编码的蛋白质主要参与抗原的识别,呈递的过程[11],[19],[20]。从多态性角度来看,经典I类和经典II类的多态性水平较高,而非经典MHC基因的多态性较低,虽然在结构上和经典I,II类MHC基因相似,但是非经典MHC基因所编码的产物主要是作为经典MHC基因的分子伴侣参与反应,且非经典MHC基因的多态性水平较低[12]。MHC基因的多态性在脊椎动物的基因组中是最高的部分之一,尤其是在MHC的I类和II类的部分。虽然在免疫系统中,单个MHC基因编码的产物仅能识别一种抗原,所以需要有足够多类型的MHC表达产物来应对环境中各种不同类型的病原体,但是这并不意味着MHC多态性越强,个体的抗病能力就越强。因为在体中,更多类型的MHC表达产物有可能会与自身产生的多肽相结合,从而产生“自身多肽-MHC”复合体,造成自身免疫病的出现,所以在个体内的MHC基因的多态性必然是有限的[11]。但是从种群的角度而言,MHC基因的多态性越强,的确意味着整个种群对于基本的抵抗能力就越强,同时对环境的适应能力也就越强。从这点来看,MHC的多态性对于整个种群的重要性可见一斑。

I类MHC分子的分布十分广泛,除了精细胞以及神经元细胞,它几乎在所有细胞中都有表达。I类MHC分子的主要结构是由两条链(alpha;链和beta;链)组成的异源二聚体[7]。alpha;链包含三个部分,分别是胞外结构域、跨膜区和胞质尾区。胞外结构域又可以再细分成alpha;1,alpha;2和alpha;3三个结构域,其中alpha;1和alpha;2由MHC基因的外显子2和外显子3编码,是I类MHC分子的抗原结合区。alpha;3结构域由外显子4编码,功能是与beta;链共价结合以及与T细胞表面的CD8 分子结合[7],[12],[20]。跨膜区的作用则是把MHC分子锚定在膜上。在大部分脊椎动物体内,beta;链是由一段非常保守的在另一条染色体上的非MHC基因编码的,主要起着稳定MHC分子结构的作用[20]

虽然目前对于MHC基因的研究已经包含了脊椎动物中几乎所有的大类,但是研究最多且最详尽的是哺乳类,对于鸟类的MHC基因的研究报道相对较少。尽管最早在上个世纪40年代就有了关于鸡中发现MHC基因踪迹的一些报道[11],但是考虑到鸟类庞大的种群数量,目前关于鸟类的MHC基因的研究资料十分有限。目前关于鸟类MHC基因研究较为深入的领域主要集中在鸡形目的几个物种上[12],[9],例如火鸡,鸡,鹌鹑等等,其余大多数鸟类,最多有针对个别物种的MHC基因的研究[9],[12],[18]。即便是在这些研究当中,所研究的MHC基因主要集中在II类MHC上,而对于I类MHC基因的研究十分罕见。所以,对于鸟类的MHC基因尤其是I类MHC基因需要有更多的更加深入的研究。本次研究将会探索并设计出黑颈鹤的MHC基因位点的引物,并对MHC基因进行克隆,然后进行测序分析。然后会根据测序结果分析出黑颈鹤MHC基因的组成和结构。最后根据已有的鸟类MHC基因的信息,研究MHC基因在鸟类进化中的特征。黑颈鹤作为我国乃至世界上都及其濒危的物种,深入研究其MHC基因,能够为之后的黑颈鹤的研究提供参考,并为黑颈鹤这一珍稀物种的保护提供更多的理论支持。

参考文献

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