杭白菊品种遗传多样性分析及特异性DNA片段筛选
摘要:杭白菊具有丰富的化学物质,并且能起到丰富的药效作用,是非常优秀的一种药用植物。由于杭白菊有遗传多样性,并且从形态上难以区分其品种,所以利用DNA分子的不同,能够准确高效快速地鉴定出杭白菊的品种,因此本研究就致力于对杭白菊遗传的多样性分析,以及其品种特异DNA的筛选,以便于鉴定不同杭白菊品种。而所用的方法就是SCoT标记,能够在其DNA特异性标记,从而能够进行种质鉴定,遗传性分析等,对其资源的保护提供有用的信息。
关键词:杭白菊; SCAR标记; SCoT;DNA片段
- 文献综述
- 杭白菊优势
杭白菊是一种常见的中草药,能够清热解毒、平肝明目、散风清热,用于头痛眩晕、眼目昏花、风热感冒具有良好的功效。现代药理研究也表明杭白菊能够解毒、散热、降压和明目,杭白菊提取物能够去除活性氧自由基、降低血液中的胆固醇和脂肪含量、改善心肌营养、增强毛细血管的抵抗力等。
杭白菊的化学成分复杂多样,含有的挥发油、黄酮类化合物、脂肪酸、绿原酸等都表现出良好的药理作用,能够降血糖、降血脂、抗衰老、保护心血管、抗菌、抗病毒以及抗炎等,具有药用价值,在多种疾病的预防和治疗中具有重要的作用[1]。
依据功用通常将菊花分为茶用菊、食用菊、药用菊和观赏菊,茶用菊中较为著名的有浙江杭白菊、安徽黄山贡菊、滁州滁菊、亳州亳菊、以及河南邓菊和怀菊等。杭白菊花瓣洁白如玉,花蕊黄如纯金,其中珍品“杭白贡菊”曾与“西湖龙井茶”媲美。杭白菊有很高药用价值[2]。
- 杭白菊种类繁多,质量不一
菊花系菊科植物菊的干燥头状花序,味甘、性寒,具有散风清热、明目、解毒等功效。作为药食两用植物,菊花在我国已有3000多年的栽培历史。菊花的化学成分较为复杂,主要有黄酮类、挥发油类、绿原酸、多糖类等。其中,菊花多糖有抗氧化、抗肿瘤、免疫调节、降血糖等多种药理活性,具有良好的预防保健作用。杭白菊原产于浙江桐乡地区,近年来由于市场需求不断扩大,杭白菊已在全国多地引种栽培。但由于各产地的气候环境、栽培方式等差异,造成各地杭白菊的质量不一[3]。
- SCAR概念
SCAR标记是由Paran提出的一种分子标记技术,该技术将其它分子标记技术扩增的特异片段进行克隆和测序,然后根据所得测序序列两端的序列,合成特异引物对,进行特异PCR扩增.由于SCAR标记是用特异引物进行扩增,排除了随机引物结合的可能,因此特异性和重复性较高.SCAR标记自开发以来,被广泛应用。
序列特征扩增区(SCAR)是由8个随机扩增多态性DNA(RAPD)标记与莴苣抗病性基因连接而得到的。SCAR是基于PCR的标记,代表单一的,基因定义的位点,通过对特定的寡核苷酸引物对基因组DNA进行PCR扩增鉴定;它们可能包含在放大区域内的高拷贝、分散的基因组序列。对扩增的RAPD产物进行克隆和测序。根据序列设计两端的24聚寡核苷酸引物。所有对SCAR引物都能扩增出与所克隆的RAPD片段相同大小的单个主带。多态性要么作为条带扩增的存在或缺失而保留,要么作为长度多态性出现,将显性RAPD位点转化为共显性SCAR标记[4]。
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