基于网络药理学的金复康优化方联合顺铂防治肺癌的活性组分辨识文献综述

 2023-02-05 20:45:49

一、拟研究或解决的问题金复康优化方(ALG-X-012)是本课题组前期在中医临床效方金复康的基础上,基于药效贡献率优化而来的抗肺癌精简方,含有黄芪、麦冬、淫羊藿和黄精四味中药。

本课题组前期对ALG-X-012在体防治肺癌药效进行了评估,研究表明金复康优化方可有效预防和治疗肺癌的发生发展,但活性组分尚不明确。

本研究借助网络药理学技术与分子对接技术,探究ALG-X-012中的抗肺癌活性组分,并初步预测其与顺铂联合治疗非小细胞肺癌的作用机制,为后续ALG-X-012联合顺铂治疗肺癌的活性组分确认、组分结构特征解析及后续制剂的临床研究奠定基础。

二、采用研究手段1.黄芪、麦冬、淫羊藿和黄精化学成分数据库建立:由中国科学院中药化学成分数据库[1]、TCMSP数据库[2]、TCMID数据库[3]检索得到,金复康优化方主要化学成分为皂苷类(如黄芪甲苷、异黄芪苷、黄芪皂苷乙、大豆皂苷、人参皂苷、薯蓣皂苷等)、黄酮类(如淫羊藿苷、淫羊藿次苷等)、有机酸类(如齐墩果酸、熊果酸、女贞子酸等)等,而其2D化学结构信息由PubChem或Chembl数据库[4]检索得到,将上述信息综合后建立化学成分数据库。

2.金复康优化方联合顺铂作用靶点数据库的建立:将各化学成分作用靶点信息由Swiss Target Prediction[4]数据库反向对接得到,顺铂靶点附加参考Drugbank中的作用靶点信息,并应用Uniprot数据库[5]的Retrieve/ID mapping工具对其进行标准化,并建立相应数据库。

3.疾病及相关基因信息数据库建立:从人类孟德尔遗传数据库[6](OMIM)、TTD数据库[7]、Drugbank数据库、DisGeNET数据库和GeneCard数据库中搜索与肺癌相关的基因信息,建立疾病及相关基因信息数据库。

合并5个数据库检索结果,并使用Uniprot数据库的Retrieve/ID mapping工具对其进行标准化。

4.金复康优化方联用顺铂成分-肺癌靶点PPI网络构建:为明晰金复康优化方相关靶点、顺铂靶点与肺癌靶点间的相互作用,利用Excel将二者靶点取交集并绘制韦恩图。

进而将交集靶点提交至STRING数据库构建蛋白互作(PPI)网络模型,提取以顺铂抗肺癌靶点为核心PPI网络,并通过CytoScape 3.6.1中的MCODE插件对PPI网络进一步分析,得到潜在的蛋白质功能模块,并通过分析其参与的生物学进程对其功能进行描述。

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