一、拟研究或解决的问题金复康优化方(ALG-X-012)是本课题组前期在中医临床效方金复康的基础上,基于药效贡献率优化而来的抗肺癌精简方,含有黄芪、麦冬、淫羊藿和黄精四味中药。
本课题组前期对ALG-X-012在体防治肺癌药效进行了评估,研究表明金复康优化方可有效预防和治疗肺癌的发生发展,但活性组分尚不明确。
本研究借助网络药理学技术与分子对接技术,探究ALG-X-012中的抗肺癌活性组分,并初步预测其与顺铂联合治疗非小细胞肺癌的作用机制,为后续ALG-X-012联合顺铂治疗肺癌的活性组分确认、组分结构特征解析及后续制剂的临床研究奠定基础。
二、采用研究手段1.黄芪、麦冬、淫羊藿和黄精化学成分数据库建立:由中国科学院中药化学成分数据库[1]、TCMSP数据库[2]、TCMID数据库[3]检索得到,金复康优化方主要化学成分为皂苷类(如黄芪甲苷、异黄芪苷、黄芪皂苷乙、大豆皂苷、人参皂苷、薯蓣皂苷等)、黄酮类(如淫羊藿苷、淫羊藿次苷等)、有机酸类(如齐墩果酸、熊果酸、女贞子酸等)等,而其2D化学结构信息由PubChem或Chembl数据库[4]检索得到,将上述信息综合后建立化学成分数据库。
2.金复康优化方联合顺铂作用靶点数据库的建立:将各化学成分作用靶点信息由Swiss Target Prediction[4]数据库反向对接得到,顺铂靶点附加参考Drugbank中的作用靶点信息,并应用Uniprot数据库[5]的Retrieve/ID mapping工具对其进行标准化,并建立相应数据库。
3.疾病及相关基因信息数据库建立:从人类孟德尔遗传数据库[6](OMIM)、TTD数据库[7]、Drugbank数据库、DisGeNET数据库和GeneCard数据库中搜索与肺癌相关的基因信息,建立疾病及相关基因信息数据库。
合并5个数据库检索结果,并使用Uniprot数据库的Retrieve/ID mapping工具对其进行标准化。
4.金复康优化方联用顺铂成分-肺癌靶点PPI网络构建:为明晰金复康优化方相关靶点、顺铂靶点与肺癌靶点间的相互作用,利用Excel将二者靶点取交集并绘制韦恩图。
进而将交集靶点提交至STRING数据库构建蛋白互作(PPI)网络模型,提取以顺铂抗肺癌靶点为核心PPI网络,并通过CytoScape 3.6.1中的MCODE插件对PPI网络进一步分析,得到潜在的蛋白质功能模块,并通过分析其参与的生物学进程对其功能进行描述。
