一、文献综述代谢组学(metabonomics/metabolomics)和蛋白质组学一样,继承了基因组学的研究模式,是系统生物学重要的组成部分。
代谢组学旨在定量分析生物体内所有代谢物,并寻找代谢物与生理病理变化的相互关系,其研究对象体内代谢物大都是小分子物质,相对分子质量在1000以内[1]。
Fiehn将细胞代谢组学定义为针对单个细胞或者单一类型细胞株的代谢调控以及代谢流中所有低分子量的代谢产物的定性、定量分析[2]。
内源性小分子是细胞内生化反应的最终产物,表现了活细胞内不同代谢通路之间的联系,可以藉此反映和评估生理和病理状态下的代谢差异,可以为人为干预代谢状态的方式和途径提供理论基础[3]。
能够对细胞内代谢物准确地定性、定量是细胞代谢组学最基本的要求,因此,样品前处理显得尤为重要。
对样品前处理提出了诸多要求,既要尽可能多地保留细胞代谢物以保证代谢信息的完整性,又要尽可能多地除去基质和包含可能的干扰性物质在内的杂质,还要使得处理后的样本性质与选择的分析方法相匹配等等;最重要的是要保证内源性代谢物的真实性、可靠性,即保证最终的分析样本包含的代谢信息可以反映出取样时刻的状态,并没有发生生化反应、混入污染物等样本失真(sample distortion)的情况。
对于靶标分析(target analysis),预处理方法应考虑对待分析组分的富集。
当然,对于不同类型的样本及不同的检测方法,前处理方法也不尽相同。
代谢组学主要对特定条件下或某一时刻细胞内代谢物进行分析,因细胞内酶系活跃、代谢转换迅速,取样和样品制备方法显著影响分析结果的准确性、重复性。
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