TNF-α诱导的Hacat细胞中差异上调lncRNA的筛选及功能验证文献综述

 2022-12-24 14:02:32

开题报告内容:(包括拟研究或解决的问题、采用的研究手段及文献综述,不少于2000字)

一、课题的研究背景、意义和目的

银屑病(Psoriasis, Ps)俗称牛皮癣,是一种慢性炎症性皮肤病,病程较长,有易复发倾向,有些患者甚至几乎终生不愈。银屑病的病理特征是角质细胞的异常增殖以及免疫炎性细胞在真皮和表皮中的浸润。虽然对Ps的发病机理进行了大量研究,但其具体致病机制至今尚不十分清楚。因此,对Ps发病机理的探究将有助于临床疾病的诊断和治疗。用肿瘤坏死因子alpha;(Tumor necrosis factor, TNF-alpha;)诱导人永生化角质形成细胞(Human immortalized keratinocytes, Hacat)是目前研究Ps细胞模型的主要方法之一。临床研究发现和健康者相比,Ps患者皮肤中某些基因的表达存在显著性差异,随着基因检测技术的发展以及人们对转录组学的深入了解,越来越多的研究证据显示非编码RNA(Non-coding RNA, ncRNA)与Ps的发病存在密切的联系。

ncRNA是指不能翻译为蛋白的功能性RNA分子,常见的具有调控作用的ncRNA包括小干扰RNA(Small interfering RNA, siRNA)、微小RNA(MicroRNA, miRNA)、piRNA(Piwi-interacting RNA)、环状RNA (Circular RNA, circRNA)、小核RNA(Small nuclear RNA, snRNA)以及长链非编码RNA(Long noncoding RNA, lncRNA)等。有研究发现,miRNA、circRNA、lncRNA等ncRNA在Ps中异常表达。lncRNA是长度大于200个核苷酸的ncRNA,在剂量补偿效应、表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多生命活动中发挥着重要作用。lncRNA在皮肤中发挥着重要的生物学功能,在Ps患者治疗前后的皮肤中差异表达,因此可作为皮肤疾病潜在的生物标志物和治疗靶点。

实时荧光定量多聚核苷酸链式反应(Real-time Quantitative polymerase chain reaction, qPCR)是一种在DNA扩增反应中,以荧光化学物质检测每次聚合酶链式反应循环后产物总量的方法,具有易操作、高通量、高敏感性、高特异性、高度自动化和低污染等优点。本课题使用qPCR的方法检测模型细胞和正常细胞中表达显著差异上调的lncRNA,并通过设计对应lncRNA的siRNA靶干扰序列,对目标lncRNA进行敲低,再用酶联免疫吸附测定(Enzyme linked immunosorbent assay, ELISA)、MTT等初步探讨lncRNA在TNF-alpha;诱导的Hacat细胞中的作用,旨在为Ps的预防和治疗提供新的临床标志物。

二、课题研究的主要内容

1、使用qPCR的方法检测模型细胞和正常细胞中的显著差异上调表达的lncRNA。

2、设计对应lncRNA的siRNA靶干扰序列,在TNF-alpha;刺激的Hacat细胞中对目标lncRNA进行敲低。

3、用ELISA、MTT等初步探讨候选lncRNA敲低对Hacat细胞增殖等的影响。

三、研究难点

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