基于松材线虫基因组序列的病毒数据挖掘文献综述

 2022-08-03 11:45:33

松材线虫体内病毒RNA提取及序列分析

摘要:松材线虫病亦称松树萎蔫病或松树枯萎病,是松树上的一种毁灭性传染病,被许多国家列为检疫对象。现阶段,在对研究松材线虫体内病毒方面国内外都是缺乏阶段,在发现松材线虫病毒颗粒后对其RNA的序列分析有效判断所属病毒,对该病有更深一步的探究,也是对全世界松树感病原因的进一步分析。

关键词:松材线虫、松材线虫病、线虫、病毒、RNA

  1. 松材线虫研究概况

1.1松材线虫的介绍

松材线虫是国际上公认的重要检疫性有害生物。它能引起松材线虫病,使感病植物迅速枯死,且传播蔓延极快,一旦发病将造成极为严重的损失,已有40多个国家将其列为检疫对象【1-2】。目前,对松材线虫病的研究主要涉及病原松材线虫的生物学特性、寄主的感病性、线虫的传播媒介等,但该病的防治和控制工作进展缓慢【3-4】,而对其所造成的环境经济影响的研究几近空白【5】

1.2松材线虫的分布

松材线虫病分布在美国、加拿大、韩国等多个国家【6】。在这些国家中,虽然病害发生较普遍,但均未引起明显损失。日本自1905年有记载以来,病害几乎席卷全国,疫区面积达65万hm2,占松林总面积的25%(1981年止)。日本的黑松、赤松、琉球松已所剩无几,损失极其严重【7】。松材线虫引发的松树萎蔫病已经成为全球性病害,其中在日本、中国和韩国发生最为严重【8】

我国也不例外,1982年秋,在南京紫金山中山陵黑松上首次发现该病害,当时仅有几十株病死木,该病先后在广东深圳(范军详,1987)、安徽马鞍山与和县(1988)、山东长岛(1990)、浙江象山(1991)、上海(1999)(2003年已根除)、湖北恩施(2000)等地发生;2001年又分别在重庆长寿区、福建三明发现(国家林业局,2002);2003年在江西赣州、湖南郴州和贵州遵义发现(国家林业局,2004);2004年又在云南德宏州发现(国家林业局,2005)。至2007年,全国已有14个省(自治区、直辖市)的185个县区发生松材线虫病。2018年2月国家林业局最新公告显示我国松材线虫病疫区已经覆盖有辽宁、江苏、浙江、安徽、福建、江西、山东、河南、湖北、湖南、广东、广西、四川、贵州、陕西部分地区【9】。现疫区面积约有33.3万公顷,已造成经济损失数千亿元。

1.3松材线虫的症状特点

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